薬害肝炎の疑いが強いとして、製薬会社が２００２年に厚生労働省に報告した４１８人分の匿名の症例一覧表のうち、約３分の１については、患者のイニシャルや医療機関名など詳細を記した個別の副作用報告書が同省に提出されていたことが判明した。
古いものは１９８７年に提出されており、同省は、患者特定につながる情報を持ちながら２０年にわたり、製薬会社に対し、本人への告知を指示するなど適切な対応を取っていなかったことになる。
副作用報告書は、止血剤として血液製剤「フィブリノゲン」を投与され、Ｃ型肝炎に感染したと見られる症例について、旧ミドリ十字（三菱ウェルファーマを経て現田辺三菱製薬）が医療機関から情報を得て、１９８７～２００２年に同省に提出したもので、計１４４人分に上る。
このうちの７３人分は、８７年に青森県で妊婦８人の集団感染が発覚したのを機に、同省の提出指示を受けて出されたもの。この中の６１人分については、８７年中に同省に報告されていた。
このほか、薬事法に基づく副作用報告などによって同省に提出されたものが、８７年指示に基づく報告との重複者も含め、計８８人分あった。このうちのほとんどは、同法で副作用報告が義務付けられた９７年以降に提出されたものだった。
報告書の形式は様々だが、多くは患者のイニシャルや性別、年齢、医療機関の所在地などの記入欄があるほか、実名や医師名が記されているものもあり、製薬会社や医療機関を通して患者本人にたどり着くことが可能とみられる。一覧表の患者は、肝炎の症状が薬害によるものと知らずにいる可能性があるが、同省は製薬会社に対し、患者に事実を告知するよう指導していなかった。